Libya'da 6.000 yıl öncesine, Neolitik döneme ait bir karpuz akrabasından gelen tohumlar, bu meyvenin tohumlarının tüketildiğini gösteriyor.
Bitkilerden elde edilen DNA'yı kullanarak, karpuzların büyük olasılıkla kuzeydoğu Afrika'daki yabani atalarından geldiği keşfedildi.